Usein (joka kymmenesosa sadasta hoidettua henkilöä) esiintyy paroksetiiniin liittyviä sivuvaikutuksia, kuten uneliaisuus, unettomuus, vapina, päänsärky, näön hämärtyminen, kaivaminen, hikoilu, heikkous ja huimaus (nämä sivuvaikutukset ovat myös erityisesti paroksetiinin liian nopean lopettamisen yhteydessä).